Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BPTFQ12830 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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