Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCAPQ12770 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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