Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC3A1Q07837 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms