Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN1Q04323 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms