Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XPCQ01831 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XPCQ01831 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
XPCQ01831 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XPCQ01831 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XPCQ01831 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
XPCQ01831 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms