Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP1P63208 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP1P63208 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP1P63208 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKP1P63208 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP1P63208 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP1P63208 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP1P63208 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKP1P63208 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP1P63208 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP1P63208 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms