Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ERVFRD-1P60508 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ERVFRD-1P60508 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms