Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCCD1P59942 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCCD1P59942 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms