Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SIK1P57059 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SIK1P57059 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIK1P57059 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms