Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTBP2P56545 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms