Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GFRA1P56159 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GFRA1P56159 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms