Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP7P55210 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP7P55210 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP7P55210 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP7P55210 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms