Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX2P52951 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX2P52951 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms