Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TTPAP49638 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TTPAP49638 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TTPAP49638 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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