Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC1A2P43004 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms