Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCGF2P35227 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCGF2P35227 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms