Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL9P32969 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL9P32969 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms