Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ALDH4A1P30038 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms