Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2E2P29084 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms