Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GIFP27352 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GIFP27352 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIFP27352 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIFP27352 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIFP27352 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GIFP27352 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GIFP27352 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms