Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRDP23468 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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