Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGS1P23219 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms