Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPI1P17947 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPI1P17947 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms