Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BRAFP15056 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRAFP15056 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRAFP15056 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRAFP15056 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRAFP15056 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BRAFP15056 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BRAFP15056 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BRAFP15056 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms