Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
APOC1P02654 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOC1P02654 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms