Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPTA1P02549 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms