Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DQB1P01920 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms