Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms