Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTSVO60911 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTSVO60911 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms