Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXO3O43524 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXO3O43524 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms