Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRRTM2O43300 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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