Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNJ2O15056 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms