Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TVP23AA6NH52 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms