Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MBD3L3A6NE82 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms