Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSDA5PKW4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms