Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SSPOA2VEC9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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