Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A3GALT2U3KPV4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms