Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THRAP3Q9Y2W1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms