Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THSD7AQ9UPZ6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THSD7AQ9UPZ6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms