Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDZRN3Q9UPQ7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms