Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TTC7AQ9ULT0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms