Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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RABGEF1Q9UJ41 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RABGEF1Q9UJ41 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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RABGEF1Q9UJ41 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1Q9UJ41 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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