Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms