Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DKK4Q9UBT3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms