Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFIP11Q9UBB9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms