Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC17A6Q9P2U8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC17A6Q9P2U8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms