Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MED17Q9NVC6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms