Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms