Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMPRSS4Q9NRS4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms