Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms